自分も同じような経験があります。毎日片道15kmくらい自転車で通勤してた時期があるんですが、3ヶ月目あたりから膝の内側が痛くなり始めました。最初は走り終わった直後だけだったのが、だんだん日常生活でも違和感を覚えるようになって。

やめるかどうかは、正直その痛みの出方次第だと思います。自分の場合は、思い切って自転車を完全にやめるのではなく、いくつか試行錯誤してみました。サドルの高さを微調整したり、ペダリングフォーム意識してみたり。あと、週に2日は電車に切り替えて負荷を減らしたんです。そしたら3週間くらいで違和感がだいぶ楽になりました。

今思うと、急に毎日乗り始めたことと、ポジション調整を甘く見てたのが原因だったのかもしれません。膝の痛みって、距離や頻度だけじゃなくて自転車のセッティングや乗り方の癖が大きく影響してる気がします。

いきなりやめるんじゃなくて、まず負荷を減らしながら原因を探ってみるのはどうでしょう。それでも改善しなければ医者に相談するのが無難だと思います。無理は禁物ですから。